У детей с целиакией, которая является аутоиммунным заболеванием, одноклеточные простейшие встречаются редко, а их колонизация остается стабильной, несмотря на прием пробиотиков.

Цель проведения этого рандомизированного двойного слепого плацебо-контролируемого клинического исследования (Профилактика целиакии с помощью пробиотиков (Celiac Disease Prevention with Probiotics, CiPP)) состояла в изучении влияния Lactiplantibacillus plantarum HEAL9 и Lacticaseibacillus paracasei 8700:2 на одноклеточных паразитов, при этом особое внимание уделялось простейшим микроорганизмам рода Blastocystis.

Образцы кала были взяты у 78 детей с диагнозом аутоиммунная целиакия, включенных в двойное слепое рандомизированное плацебо-контролируемое клиническое исследование. Детей рандомизировали в группу комбинации добавок L. plantarum HEAL9 и L. paracasei 8700:2 (n = 38) или в группу плацебо (n = 40). В общей сложности было ретроспективно исследовано 227 образцов кала, собранных на исходном уровне, через 3 и 6 месяцев во время вмешательства.

Анализ включал количественное определение Blastocystis методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (ПЦР) с подтипированием, выполненным с использованием массово-параллельного секвенирования ампликонов. Кроме того, идентификацию других одноклеточных паразитов проводили с помощью нецелевого секвенирования ампликона 18S рДНК и ПЦР в режиме реального времени. Наличие взаимодействия между паразитами и микробиомом оценивали путем профилирования области V3-V4 16S рДНК.

Были выявлены три отдельных вида одноклеточных простейших, при этом частота выявления микроорганизмов вида Dientamoeba fragilis (23,1 %, 18 из 78 детей) была самой высокой, за которыми следовали Blastocystis (15,4 %, 12 из 78 детей) и представители рода Entamoeba (2,6 %, 2 из 78). Прием пробиотиков не повлиял на численность этих простейших, и она оставалась постоянной с течением времени. Присутствие этих простейших было связано с повышенным разнообразием микробиома, которое оценивали по нескольким показателям.

На бактериальный состав повлияло присутствие простейших; в частности, положительный результат теста на Blastocystis обратно коррелировал с Akkermansia (как на уровне рода, так и на более высоком таксономическом уровне), Romboutsia и Faecalibacterium. Аналогично, положительный результат теста на D. fragilis обратно коррелировал с семействами Coriobacteriaceae и Enterobacteriaceae, а также с родами Granulicatella, Ruminococcus, Lachnoclostridium, Faecalibacterium и Flavonifractor.

Частота обнаружения одноклеточных простейших у детей с аутоиммунной целиакией минимальна. Несмотря на прием пробиотиков, колонизация оставалась постоянной и была связана с повышенным разнообразием фекального микробиома, хотя была отмечена обратная корреляция с некоторыми полезными бактериями.