В журнале Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS) была опубликована работа группы исследователей из Калифорнийского университета, посвящённая длинной некодирующей РНК LOUP, её влиянию на распределение макрофагов и предупреждение воспалений.
Некодирующие РНК — это молекулы РНК, не транскрибирующиеся в белки. Недавно было обнаружено, что некоторые из них кодируют пептиды (белковые цепочки с биологически значимой функцией). Длинные некодирующие РНК (днкРНК), как правило, содержат более двухсот нуклеотидов. На данный момент для генома человека описано более двадцати тысяч, но функциональная аннотация есть лишь у нескольких сотен.
Группа учёных из Калифорнийского университета провела два скрининга, основанных на технологии CRISPRi, модификации классической CRISPR/Cas9. Первый из них был направлен на изучение длинных некодирующих РНК, влияющих на распределение макрофагов. Второй — на анализ днкРНК, ответственных за реакцию организма на воспаления. После обработки данных было решено сосредоточиться на LOUP, оказавшейся в топе влияния в обоих исследованиях и связанной с геном SPI1.
Исследование LOUP показало важность её участия в превращении моноцитов в макрофаги — основу иммунного ответа организма. Было обнаружено, что эта днкРНК имеет три способа считывания, которые и определяют, каким образом последовательность нуклеотидов будет преобразована в аминокислотную последовательность пептида.
Дополнительные исследования показали, что роль этой РНК в иммунном процессе сильно недооценена. Её подавление привело к нарушению регуляции транскрипционного фактора NFkB, прямо связанного с опасностью воспалений, аутоиммунных заболеваний и рака.
Открытый пептид может оказать заметное влияние на терапию воспалительных реакций различной природы.
PNAS
CRISPRi screens identify the lncRNA, LOUP, as a multifunctional locus regulating macrophage differentiation and inflammatory signaling
Комментарии (0)